从出身起就被顶刊注视的单细胞测序、空间组学技术，几年来热度未减。在刚刚过去的三月，就有九篇文章登上了 CNS 等定级期刊，IF 均高达 60！综述、技术升级、生命机制和生长发育研究、临床研究等多领域均有亮眼表现。 3 月 6 日，发表在 Nature Biotechnology 的 ...

近年来，空间转录组技术（Spatial Transcriptomics, ST）迅速发展，为探索细胞功能、调控机制及微环境互作提供了前所未有的空间视角。它被 Nature Methods 评为2020年度技术（Method of the Year 2020），并被誉为“将彻底改变细胞生物学、病理学及组织学的研究方式”。

近日，上海交通大学公共卫生学院、上海交通大学医学院单细胞组学与疾病研究中心郑小琪课题组在基因组学权威杂志Genome Research上发表题为STCC enhances spatial domain detection through consensus clustering of spatial transcriptomics data的研究论文。该研究创新性地开发了针对空间 ...

打开微信，点击底部的“发现”， 使用“扫一扫”即可将网页分享到朋友圈。 分享： 2025/05/26 17:39:11 导读： CRISPR-TO技术实现了对内源RNA空间定位的精准调控，为研究RNA功能及相关疾病提供了新工具。 近日，美国斯坦福大学的亓磊实验室在Nature杂志在线发表了 ...

2024年7月25日，来自东南大学的谢芃研究员和林承棋、罗卓娟教授领衔的研究团队，在权威生物信息学期刊《Bioinformatics》上发表了题为“SpatialQC: automated quality control for spatial transcriptome data”的研究论文。该研究的核心贡献在于开发了SpatialQC这一创新工具，填补了 ...

时间：2024-05-21 14:39 来源：华中农业大学 原文: 核心提示：近日，作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室杨宁教授、刘磊教授课题组联合深圳华大研究院刘欢研究员课题组研究成果以“A spatial transcriptome map of the developing maize ear”为题在Nature Plants发表。

研究成果以《SPACEL: deep learning-based characterization of spatial transcriptome architectures》为题，发表于2023年11月22日的《自然-通讯》(Nature Communications)杂志 近日，中国科学技术大学瞿昆教授课题组成功开发了一种基于深度学习的空间转录组数据分析算法，命名为SPACEL。

该研究产生了较为完整的世界首套猕猴全脑皮层的单细胞以及空间转录组数据，为后续的相关研究提供了重要的数据资源库，现已实现公开共享。 《细胞》（Cell）在线发表了题为Single-cell spatial transcriptome reveals cell-type organization in macaque cortex的研究论文。

中国脑科学研究取得新进展。 7 月 12 日，中国科学家发布世界首套单细胞分辨率的猕猴大脑皮层细胞空间分布图谱，研究成果在国际知名学术期刊 Cell（《细胞》）刊登。该研究为系统的分析大脑皮层中不同层面和区域的细胞类型分布及其基因表达特征，提供了 ...

7月12日，《细胞》（Cell）在线发表了题为Single-cell spatial transcriptome reveals cell-type organization in macaque cortex的研究论文。该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心与华大生命科学研究院、临港实验室、上海脑科学与类脑研究中心、腾讯AI Lab、深圳国家 ...